Существуют вирусы, которые заражают загрузочные секторы дисков. Загрузочный сектор имеется на любом диске, причем записанные в нем данные информируют компьютер о том, каким образом следует использовать данный диск. Вирусы,поражающие загрузочные секторы, распространяются при каждой загрузке с зараженного жесткого или съемного (гибкого, ZIP, CD и др.) диска. Поскольку загрузочный сектор с инструкциями компьютеру относительно порядка использования данного диска имеется на каждом диске, то вирусы этого типа могут инфицировать любые съемные носители данных.